| الإصدار | 1.5 |
|---|---|
| الناشر | Bioinformatics Solutions |
| يوم الاصدار | ١٨/٠٥/٢٠١٠ |
| تم إضافة التاريخ | ١٤/٠٧/٢٠١٠ |
| متطلبات نظام التشغيل | Windows XP/Vista/7 |
| المتطلبات | None |
| إجمالي التنزيلات | ١٬٠٣٤ |
| التنزيلات في الأسبوع | ٢١ |
| السعر | Free |
وصف
ZOOM Lite هو برنامج من الجيل التالي لرسم خرائط البيانات والتصور. يقوم المستخدمون بإدخال الجينوم المرجعي و Illumina/Solexa يقرأ الملفات القصيرة أو مساحة ألوان AB SOLiD تقرأ الملفات بتنسيقات مختلفة ، مثل * .fasta ، * .fastq ، * _seq.txt ، * .csfasta إلخ. تُخرج ZOOM نتائج التعيين لهذه الملفات القصيرة يقرأ على التسلسل المرجعي. يحتوي ZOOM Lite على نواة خرائط سريعة ودقيقة تستند إلى نظرية بذور متعددة التباعد مصممة حديثًا. يمكن معالجة القراءات أحادية النهاية والنهاية المزدوجة بأطوال مختلفة من 15 نقطة أساس إلى 240 نقطة في البوصة. يُسمح بأي عدد من حالات عدم التطابق وإدخال/حذف واحد بأطوال مختلفة بين القراءة والمنطقة المستهدفة في التسلسل المرجعي. سيتم الإبلاغ عن النتائج المعينة بشكل فريد أو أفضل النتائج (أعلى N) لكل قراءة وفقًا للحد الأدنى من عدم التطابق وطول indel. يتم استخدام درجات الجودة لتحسين دقة الخرائط. استنادًا إلى نواة التعيين ، يتيح ZOOM Lite للمستخدمين تحميل بيانات القراءة المحلية وبيانات التسلسل المرجعي ، وتحديد المعلمات المناسبة ، ومعالجة البيانات ذات الحجم الكبير بالتوازي بين ما يصل إلى أربع وحدات معالجة مركزية ، ومراقبة المهام قيد التشغيل ، وتخزين نتائج التعيين ، وعرض الرسوم البيانية لـ نتائج تعيين النتائج وتعيين النتائج إما بتنسيقات ملفات * .BED أو * .GFF لمزيد من المسح باستخدام معلومات تتبع مستعرض UCSC. يمكن عرض نتائج التعيين في أي مقياس مرغوب ، من الرسم البياني لعمق القراءة على كروموسوم كامل إلى محاذاة التسلسل التفصيلي بين القراءات والتسلسل المرجعي. يتنقل المستخدمون بسهولة إلى مناطق الاهتمام ببساطة عن طريق النقر والسحب أو التمرير. ZOOM Lite هو أحد مشتقات برنامج ZOOM Studio.
